桑耶寺坐北朝南，平面呈橢圓形，其建築布局依據佛經中世界構造進行設計，以古印度波羅王朝歐丹達菩提寺為藍本興建，按密宗曼陀羅形式布局。整座寺院建築類型豐富，包含中心主殿烏孜大殿、象徵四大部洲及八小洲的神殿、代表日月光輝的日殿和月殿、具有特殊象徵意義的四塔（白塔、紅塔、黑塔、綠塔），以及圍牆、護法神殿、僧舍、經房、倉庫等配套建築，各建築均有其獨特的形態、構造和象徵意義，共同構成了桑耶寺宏大而精美的建築群，展現出濃郁的宗教文化和建築藝術特色。

總體佈局

桑耶寺整個寺廟坐北朝南，平面為橢圓形，按佛經中的世界構造進行布局，似一長形院落，佔地面積約 2.5 萬平米。其以古印度波羅王朝在摩揭陀所建的歐丹達菩提寺為藍本興建，建築格局依密宗的曼陀羅建造，是依照佛經中的 “大千世界” 結構布局設計而成。

中心主殿 —— 烏孜大殿

位置及象徵意義：位於全寺中心，象徵宇宙中心的須彌山。
建築風格：大殿坐西朝東，高三層，建築面積達 6000 多平方米。底層採用藏族建築形式，中層採用漢族建築形式，上層採用印度建築形式。各層的壁畫和塑像也都按照各自不同的法式進行繪畫和雕塑。

殿內設施：大殿和甬道回廊里均繪滿了各種題材的壁畫，如 “西藏史” 壁畫、“桑耶寺史記” 壁畫、“蓮花生傳記” 壁畫等。此外，在烏孜大殿東大門前有一高達九層的格古康，即展佛殿。

四大部洲及八小洲神殿

四大部洲神殿：烏孜大殿四方各建一殿，分別象徵四咸海中的四大部洲，東面諸洲（寺院）色呈白水晶色，南面諸洲為藍琉璃色，西面諸洲為紅瑪瑙色，北面諸洲色黃如天然之黃金。
八小洲神殿：四方各殿的附近，各有兩座小殿，象徵八小洲。
日、月殿
主殿兩旁建有的兩座小殿，分別象徵宇宙中的日、月。

桑耶寺四方紅綠黑白四塔

白塔

白塔為四方形密簷式磚塔，8層，高約18米，建在大殿東南角，形制與北京北海的白塔略，皆用石塊、石板砌成，因塔體全為白色故名“白塔”。在塔基的方形圍牆上，立有108座小塔，塔身方形，在腰部以上逐層收分如階梯，上有覆缽形塔腹。但覆缽扁平而寬大，沒有龕門，寶刹上置十七環相輪。在轉經道旁有十六羅漢石像，分別雕刻在邊長為0.74米的方形石板上，極為精緻。

黑塔

黑塔，7層，高約15米，建在大殿的西北角。塔形也很特殊，塔身如三疊覆鍋，刹盤上托寶劍。第二級相輪七環，上即瓶蓋和寶珠。塔身為條磚砌成，全為黑色。

紅塔

紅塔，16層，高約35米，建在大殿的西南角，造形極為特殊，塔身用磚石砌成，形方而實圓，狀如覆鐘，腰部以上呈環狀紋，上部為覆缽形塔腹，寶刹之上置兩段相輪，上為七環，下為九環，塔身為土紅色並泛有光澤。 

綠塔

綠塔，4層，高約10米，建在大殿的東北角，平面呈四方多角形。塔基甚高，沿階數級而達第一層，四面各有龕室三間，內有塑像，每面都有明梯通往二層。二層每面只有龕室一間，亦各有塑像。第三層為覆缽形的塔身，上置相輪寶刹，刹身很長。相輪分為三級，每一級自方形託盤上置相輪九環，中間一段為第二級，有相輪七環，第三級有相輪五環。傘蓋上承寶瓶和寶珠。塔身為綠色琉璃磚砌成。磚為土加粗沙燒制，質地堅硬，釉色蒼鬱而富光澤，極其精美。

文化意義

宗教意義：桑耶寺是藏傳佛教寧瑪派的重要寺院，是西藏佛教史上具有劃時代意義的一座寺廟。它的建成標誌著佛教正式在吐蕃紮根，為佛教在西藏的傳播和發展奠定了堅實的基礎。寺內珍藏著大量的佛教經典、佛像、唐卡等宗教文物，是佛教信徒朝拜和修行的重要場所，對傳承和弘揚藏傳佛教教義、培養佛教人才發揮了重要作用。
藝術價值：桑耶寺的建築藝術堪稱一絕，其整體布局按照佛教的宇宙觀進行設計，以烏孜大殿為中心，象徵著須彌山，周圍的四大部洲、八小洲等建築則象徵著世界的各個部分，這種獨特的布局體現了佛教對世界的認知和理解。寺內的壁畫、雕塑等藝術作品也具有極高的藝術價值，壁畫內容豐富多樣，涵蓋了佛教故事、歷史傳說、宗教儀式等多個方面，其繪畫技巧精湛，色彩鮮豔，保存至今仍具有很強的藝術感染力；雕塑則包括佛像、菩薩像、護法神像等，造型生動，工藝精細，是藏傳佛教藝術的傑出代表。
歷史文化價值：桑耶寺見證了西藏歷史上佛教與苯教的鬥爭與融合，以及吐蕃王朝政治、經濟、文化的發展變遷。寺內保存的大量歷史文獻和文物，為研究西藏古代歷史、宗教、文化、藝術等方面提供了珍貴的實物資料。例如，寺內的「桑耶寺志」壁畫，詳細描繪了桑耶寺的建造過程和歷史事件，是研究桑耶寺歷史的重要依據。同時，桑耶寺也是不同民族文化交流與融合的產物，其建築風格和藝術形式融合了藏、漢、印等民族的文化元素，體現了古代各民族之間的文化交流與合作，對於研究民族文化交流史具有重要意義。

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